Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms