Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
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