Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
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