Protein–RNA interactions for Protein: Q12408

NPC2, Phosphatidylglycerol/phosphatidylinositol transfer protein, yeastyeast

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NPC2Q12408 BNI4YNL233W 2679 nt3.14□□□□□ -1.91
NPC2Q12408 RPA135YPR010C 3612 nt3.14□□□□□ -1.91
NPC2Q12408 YDL041WYDL041W 354 nt3.14□□□□□ -1.91
NPC2Q12408 CSN9YDR179C 489 nt3.14□□□□□ -1.91
NPC2Q12408 RPS24AYER074W 408 nt3.14□□□□□ -1.91
NPC2Q12408 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt3.14□□□□□ -1.91
NPC2Q12408 RPL22AYLR061W 366 nt3.14□□□□□ -1.91
NPC2Q12408 RPS8AYBL072C 603 nt3.14□□□□□ -1.91
NPC2Q12408 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt3.14□□□□□ -1.91
NPC2Q12408 snR49snR49 165 nt3.14□□□□□ -1.91
NPC2Q12408 RIF1YBR275C 5751 nt3.14□□□□□ -1.91
NPC2Q12408 TMA108YIL137C 2841 nt3.14□□□□□ -1.91
NPC2Q12408 GPI13YLL031C 3054 nt3.13□□□□□ -1.91
NPC2Q12408 BIT61YJL058C 1632 nt3.13□□□□□ -1.91
NPC2Q12408 YDL062WYDL062W 426 nt3.13□□□□□ -1.91
NPC2Q12408 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt3.13□□□□□ -1.91
NPC2Q12408 YIL058WYIL058W 285 nt3.13□□□□□ -1.91
NPC2Q12408 ANB1YJR047C 474 nt3.13□□□□□ -1.91
NPC2Q12408 SDH2YLL041C 801 nt3.13□□□□□ -1.91
NPC2Q12408 YPL182CYPL182C 384 nt3.13□□□□□ -1.91
NPC2Q12408 SWD3YBR175W 948 nt3.13□□□□□ -1.91
NPC2Q12408 snR42snR42 351 nt3.13□□□□□ -1.91
NPC2Q12408 MGR1YCL044C 1254 nt3.13□□□□□ -1.91
NPC2Q12408 YNL034WYNL034W 1839 nt3.13□□□□□ -1.91
NPC2Q12408 RSC1YGR056W 2787 nt3.13□□□□□ -1.91
NPC2Q12408 GPI10YGL142C 1851 nt3.13□□□□□ -1.91
NPC2Q12408 NUP82YJL061W 2142 nt3.13□□□□□ -1.91
NPC2Q12408 DAN4YJR151C 3486 nt3.12□□□□□ -1.91
NPC2Q12408 SEC15YGL233W 2733 nt3.12□□□□□ -1.91
NPC2Q12408 snR191snR191 274 nt3.12□□□□□ -1.91
NPC2Q12408 MCD1YDL003W 1701 nt3.11□□□□□ -1.91
NPC2Q12408 FAS1YKL182W 6156 nt3.11□□□□□ -1.91
NPC2Q12408 HSK3YKL138C-A 210 nt3.11□□□□□ -1.91
NPC2Q12408 ESF2YNR054C 951 nt3.11□□□□□ -1.91
NPC2Q12408 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt3.11□□□□□ -1.91
NPC2Q12408 RPS7AYOR096W 573 nt3.11□□□□□ -1.91
NPC2Q12408 ERB1YMR049C 2424 nt3.11□□□□□ -1.91
NPC2Q12408 ECM5YMR176W 4236 nt3.11□□□□□ -1.91
NPC2Q12408 YPK1YKL126W 2043 nt3.1□□□□□ -1.91
NPC2Q12408 SPT16YGL207W 3108 nt3.1□□□□□ -1.91
NPC2Q12408 YFH1YDL120W 525 nt3.1□□□□□ -1.91
NPC2Q12408 YGR151CYGR151C 336 nt3.1□□□□□ -1.91
NPC2Q12408 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt3.1□□□□□ -1.91
NPC2Q12408 YPR108W-AYPR108W-A 213 nt3.1□□□□□ -1.91
NPC2Q12408 TIM12YBR091C 330 nt3.1□□□□□ -1.91
NPC2Q12408 PHO81YGR233C 3537 nt3.1□□□□□ -1.91
NPC2Q12408 TFB1YDR311W 1929 nt3.1□□□□□ -1.91
NPC2Q12408 RAD2YGR258C 3096 nt3.1□□□□□ -1.91
NPC2Q12408 SIP3YNL257C 3690 nt3.09□□□□□ -1.91
NPC2Q12408 CHS3YBR023C 3498 nt3.09□□□□□ -1.91
NPC2Q12408 HCS1YKL017C 2052 nt3.09□□□□□ -1.91
NPC2Q12408 YDR048CYDR048C 315 nt3.09□□□□□ -1.91
NPC2Q12408 YKR033CYKR033C 426 nt3.09□□□□□ -1.91
NPC2Q12408 HTB2YBL002W 396 nt3.09□□□□□ -1.91
NPC2Q12408 RPS18BYML026C 441 nt3.09□□□□□ -1.91
NPC2Q12408 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt3.09□□□□□ -1.91
NPC2Q12408 STT4YLR305C 5703 nt3.09□□□□□ -1.91
NPC2Q12408 LEU3YLR451W 2661 nt3.09□□□□□ -1.91
NPC2Q12408 VBA4YDR119W 2307 nt3.09□□□□□ -1.92
NPC2Q12408 AIM9YER080W 1884 nt3.09□□□□□ -1.92
NPC2Q12408 NPR1YNL183C 2373 nt3.09□□□□□ -1.92
NPC2Q12408 MCD4YKL165C 2760 nt3.08□□□□□ -1.92
NPC2Q12408 NSP1YJL041W 2472 nt3.08□□□□□ -1.92
NPC2Q12408 FMP32YFL046W 624 nt3.08□□□□□ -1.92
NPC2Q12408 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt3.08□□□□□ -1.92
NPC2Q12408 RPA34YJL148W 702 nt3.08□□□□□ -1.92
NPC2Q12408 SOD1YJR104C 465 nt3.08□□□□□ -1.92
NPC2Q12408 SHH3YMR118C 591 nt3.08□□□□□ -1.92
NPC2Q12408 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt3.08□□□□□ -1.92
NPC2Q12408 XRS2YDR369C 2565 nt3.08□□□□□ -1.92
NPC2Q12408 RNR1YER070W 2667 nt3.08□□□□□ -1.92
NPC2Q12408 CDC24YAL041W 2565 nt3.07□□□□□ -1.92
NPC2Q12408 RAD61YDR014W 1944 nt3.07□□□□□ -1.92
NPC2Q12408 LRG1YDL240W 3054 nt3.07□□□□□ -1.92
NPC2Q12408 tV(CAC)DtV(CAC)D 73 nt3.07□□□□□ -1.92
NPC2Q12408 tV(CAC)HtV(CAC)H 73 nt3.07□□□□□ -1.92
NPC2Q12408 CCW14YLR390W-A 717 nt3.07□□□□□ -1.92
NPC2Q12408 IES4YOR189W 351 nt3.07□□□□□ -1.92
NPC2Q12408 SHQ1YIL104C 1524 nt3.07□□□□□ -1.92
NPC2Q12408 YJL181WYJL181W 1836 nt3.07□□□□□ -1.92
NPC2Q12408 DBP6YNR038W 1890 nt3.07□□□□□ -1.92
NPC2Q12408 MDN1YLR106C 14733 nt3.07□□□□□ -1.92
NPC2Q12408 BRO1YPL084W 2535 nt3.07□□□□□ -1.92
NPC2Q12408 APC11YDL008W 498 nt3.06□□□□□ -1.92
NPC2Q12408 snR79snR79 84 nt3.06□□□□□ -1.92
NPC2Q12408 YIL102CYIL102C 306 nt3.06□□□□□ -1.92
NPC2Q12408 LSM1YJL124C 519 nt3.06□□□□□ -1.92
NPC2Q12408 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt3.06□□□□□ -1.92
NPC2Q12408 RPL36BYPL249C-A 303 nt3.06□□□□□ -1.92
NPC2Q12408 YBR064WYBR064W 429 nt3.06□□□□□ -1.92
NPC2Q12408 RRP5YMR229C 5190 nt3.06□□□□□ -1.92
NPC2Q12408 MSR1YHR091C 1932 nt3.05□□□□□ -1.92
NPC2Q12408 ETP1YHL010C 1758 nt3.05□□□□□ -1.92
NPC2Q12408 TAF6YGL112C 1551 nt3.05□□□□□ -1.92
NPC2Q12408 FUS1YCL027W 1539 nt3.05□□□□□ -1.92
NPC2Q12408 REG1YDR028C 3045 nt3.05□□□□□ -1.92
NPC2Q12408 GYP7YDL234C 2241 nt3.05□□□□□ -1.92
NPC2Q12408 SEG1YMR086W 2883 nt3.05□□□□□ -1.92
NPC2Q12408 MSH2YOL090W 2895 nt3.04□□□□□ -1.92
NPC2Q12408 RPS17BYDR447C 411 nt3.04□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 60.3 ms