Protein–RNA interactions for Protein: Q12391

TY1A-NL1, Transposon Ty1-NL1 Gag polyprotein, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-NL1Q12391 YLR364C-AYLR364C-A 123 nt3.55□□□□□ -1.84
TY1A-NL1Q12391 RPL36AYMR194W 303 nt3.55□□□□□ -1.84
TY1A-NL1Q12391 YMR321CYMR321C 318 nt3.55□□□□□ -1.84
TY1A-NL1Q12391 NUP82YJL061W 2142 nt3.55□□□□□ -1.84
TY1A-NL1Q12391 CAF130YGR134W 3369 nt3.54□□□□□ -1.84
TY1A-NL1Q12391 ORC2YBR060C 1863 nt3.54□□□□□ -1.84
TY1A-NL1Q12391 GYP7YDL234C 2241 nt3.54□□□□□ -1.84
TY1A-NL1Q12391 FUN12YAL035W 3009 nt3.54□□□□□ -1.84
TY1A-NL1Q12391 PCC1YKR095W-A 267 nt3.54□□□□□ -1.84
TY1A-NL1Q12391 YLR154W-BYLR154W-B 165 nt3.54□□□□□ -1.84
TY1A-NL1Q12391 YML116W-AYML116W-A 303 nt3.54□□□□□ -1.84
TY1A-NL1Q12391 HHT1YBR010W 411 nt3.54□□□□□ -1.84
TY1A-NL1Q12391 SAR1YPL218W 573 nt3.54□□□□□ -1.84
TY1A-NL1Q12391 MTR10YOR160W 2919 nt3.54□□□□□ -1.84
TY1A-NL1Q12391 IOC3YFR013W 2364 nt3.54□□□□□ -1.84
TY1A-NL1Q12391 TRK1YJL129C 3708 nt3.53□□□□□ -1.84
TY1A-NL1Q12391 YNR065CYNR065C 3351 nt3.53□□□□□ -1.84
TY1A-NL1Q12391 SMT3YDR510W 306 nt3.53□□□□□ -1.84
TY1A-NL1Q12391 YBL053WYBL053W 375 nt3.53□□□□□ -1.84
TY1A-NL1Q12391 YNL028WYNL028W 318 nt3.53□□□□□ -1.84
TY1A-NL1Q12391 YBR224WYBR224W 516 nt3.53□□□□□ -1.84
TY1A-NL1Q12391 YGR237CYGR237C 2358 nt3.53□□□□□ -1.84
TY1A-NL1Q12391 YDR089WYDR089W 2610 nt3.53□□□□□ -1.84
TY1A-NL1Q12391 YGR250CYGR250C 2346 nt3.53□□□□□ -1.84
TY1A-NL1Q12391 YPK1YKL126W 2043 nt3.53□□□□□ -1.84
TY1A-NL1Q12391 CHD1YER164W 4407 nt3.52□□□□□ -1.85
TY1A-NL1Q12391 SPT23YKL020C 3249 nt3.52□□□□□ -1.85
TY1A-NL1Q12391 snR79snR79 84 nt3.52□□□□□ -1.85
TY1A-NL1Q12391 FMP32YFL046W 624 nt3.52□□□□□ -1.85
TY1A-NL1Q12391 SWC7YLR385C 399 nt3.52□□□□□ -1.85
TY1A-NL1Q12391 LDS2YOL047C 1071 nt3.52□□□□□ -1.85
TY1A-NL1Q12391 YBR141W-AYBR141W-A 96 nt3.52□□□□□ -1.85
TY1A-NL1Q12391 CDH1YGL003C 1701 nt3.52□□□□□ -1.85
TY1A-NL1Q12391 UBP5YER144C 2418 nt3.52□□□□□ -1.85
TY1A-NL1Q12391 KHA1YJL094C 2622 nt3.52□□□□□ -1.85
TY1A-NL1Q12391 YIL166CYIL166C 1629 nt3.52□□□□□ -1.85
TY1A-NL1Q12391 CUL3YGR003W 2235 nt3.51□□□□□ -1.85
TY1A-NL1Q12391 CDC24YAL041W 2565 nt3.51□□□□□ -1.85
TY1A-NL1Q12391 YGL239CYGL239C 315 nt3.51□□□□□ -1.85
TY1A-NL1Q12391 RRT15YLR162W-A 189 nt3.51□□□□□ -1.85
TY1A-NL1Q12391 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt3.51□□□□□ -1.85
TY1A-NL1Q12391 YPR146CYPR146C 330 nt3.51□□□□□ -1.85
TY1A-NL1Q12391 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt3.51□□□□□ -1.85
TY1A-NL1Q12391 NMA111YNL123W 2994 nt3.51□□□□□ -1.85
TY1A-NL1Q12391 BCK2YER167W 2556 nt3.51□□□□□ -1.85
TY1A-NL1Q12391 FAA1YOR317W 2103 nt3.5□□□□□ -1.85
TY1A-NL1Q12391 VPS64YDR200C 1815 nt3.5□□□□□ -1.85
TY1A-NL1Q12391 YIL058WYIL058W 285 nt3.5□□□□□ -1.85
TY1A-NL1Q12391 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt3.5□□□□□ -1.85
TY1A-NL1Q12391 TRM7YBR061C 933 nt3.5□□□□□ -1.85
TY1A-NL1Q12391 BIT61YJL058C 1632 nt3.5□□□□□ -1.85
TY1A-NL1Q12391 FOX2YKR009C 2703 nt3.5□□□□□ -1.85
TY1A-NL1Q12391 FAT1YBR041W 2010 nt3.49□□□□□ -1.85
TY1A-NL1Q12391 SPT6YGR116W 4356 nt3.49□□□□□ -1.85
TY1A-NL1Q12391 URB2YJR041C 3525 nt3.49□□□□□ -1.85
TY1A-NL1Q12391 NPC2YDL046W 522 nt3.49□□□□□ -1.85
TY1A-NL1Q12391 GON7YJL184W 372 nt3.49□□□□□ -1.85
TY1A-NL1Q12391 RRN6YBL014C 2685 nt3.49□□□□□ -1.85
TY1A-NL1Q12391 KIP3YGL216W 2418 nt3.49□□□□□ -1.85
TY1A-NL1Q12391 YDL176WYDL176W 2127 nt3.48□□□□□ -1.85
TY1A-NL1Q12391 YGL217CYGL217C 342 nt3.48□□□□□ -1.85
TY1A-NL1Q12391 YJL222W-BYJL222W-B 138 nt3.48□□□□□ -1.85
TY1A-NL1Q12391 CSE2YNR010W 450 nt3.48□□□□□ -1.85
TY1A-NL1Q12391 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt3.48□□□□□ -1.85
TY1A-NL1Q12391 YNL034WYNL034W 1839 nt3.48□□□□□ -1.85
TY1A-NL1Q12391 YKL050CYKL050C 2769 nt3.48□□□□□ -1.85
TY1A-NL1Q12391 YRM1YOR172W 2361 nt3.47□□□□□ -1.85
TY1A-NL1Q12391 YOR015WYOR015W 360 nt3.47□□□□□ -1.85
TY1A-NL1Q12391 snR52snR52 92 nt3.47□□□□□ -1.85
TY1A-NL1Q12391 KIN2YLR096W 3444 nt3.47□□□□□ -1.85
TY1A-NL1Q12391 YBR225WYBR225W 2703 nt3.47□□□□□ -1.85
TY1A-NL1Q12391 GPI13YLL031C 3054 nt3.47□□□□□ -1.85
TY1A-NL1Q12391 LEU3YLR451W 2661 nt3.47□□□□□ -1.85
TY1A-NL1Q12391 TCP1YDR212W 1680 nt3.46□□□□□ -1.85
TY1A-NL1Q12391 HDA3YPR179C 1968 nt3.46□□□□□ -1.86
TY1A-NL1Q12391 ECM5YMR176W 4236 nt3.46□□□□□ -1.86
TY1A-NL1Q12391 YJL181WYJL181W 1836 nt3.46□□□□□ -1.86
TY1A-NL1Q12391 YPR003CYPR003C 2265 nt3.46□□□□□ -1.86
TY1A-NL1Q12391 PUF6YDR496C 1971 nt3.45□□□□□ -1.86
TY1A-NL1Q12391 GSC2YGR032W 5688 nt3.45□□□□□ -1.86
TY1A-NL1Q12391 PFK26YIL107C 2484 nt3.45□□□□□ -1.86
TY1A-NL1Q12391 YGL074CYGL074C 327 nt3.45□□□□□ -1.86
TY1A-NL1Q12391 RPS7AYOR096W 573 nt3.45□□□□□ -1.86
TY1A-NL1Q12391 VID27YNL212W 2349 nt3.45□□□□□ -1.86
TY1A-NL1Q12391 CPA2YJR109C 3357 nt3.45□□□□□ -1.86
TY1A-NL1Q12391 MCM7YBR202W 2538 nt3.45□□□□□ -1.86
TY1A-NL1Q12391 SLM2YNL047C 1971 nt3.45□□□□□ -1.86
TY1A-NL1Q12391 TFB1YDR311W 1929 nt3.44□□□□□ -1.86
TY1A-NL1Q12391 MSD1YPL104W 1977 nt3.44□□□□□ -1.86
TY1A-NL1Q12391 SMD1YGR074W 441 nt3.44□□□□□ -1.86
TY1A-NL1Q12391 DLS1YJL065C 504 nt3.44□□□□□ -1.86
TY1A-NL1Q12391 RPS27AYKL156W 249 nt3.44□□□□□ -1.86
TY1A-NL1Q12391 snR46snR46 197 nt3.44□□□□□ -1.86
TY1A-NL1Q12391 SSE1YPL106C 2082 nt3.43□□□□□ -1.86
TY1A-NL1Q12391 ABP140YOR239W 1887 nt3.43□□□□□ -1.86
TY1A-NL1Q12391 BRO1YPL084W 2535 nt3.43□□□□□ -1.86
TY1A-NL1Q12391 APE2YKL157W 2859 nt3.43□□□□□ -1.86
TY1A-NL1Q12391 SEG1YMR086W 2883 nt3.43□□□□□ -1.86
TY1A-NL1Q12391 KRE5YOR336W 4098 nt3.43□□□□□ -1.86
TY1A-NL1Q12391 RBK1YCR036W 1002 nt3.43□□□□□ -1.86
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