Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms