Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK18Q07002 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms