Protein–RNA interactions for Protein: Q05925

EN1, Homeobox protein engrailed-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EN1Q05925 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EN1Q05925 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EN1Q05925 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EN1Q05925 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EN1Q05925 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EN1Q05925 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EN1Q05925 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EN1Q05925 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EN1Q05925 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EN1Q05925 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EN1Q05925 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EN1Q05925 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EN1Q05925 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EN1Q05925 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EN1Q05925 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EN1Q05925 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EN1Q05925 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EN1Q05925 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EN1Q05925 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EN1Q05925 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EN1Q05925 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
EN1Q05925 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EN1Q05925 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EN1Q05925 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EN1Q05925 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
EN1Q05925 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EN1Q05925 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EN1Q05925 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EN1Q05925 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EN1Q05925 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EN1Q05925 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EN1Q05925 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EN1Q05925 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EN1Q05925 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EN1Q05925 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EN1Q05925 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EN1Q05925 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EN1Q05925 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EN1Q05925 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
EN1Q05925 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EN1Q05925 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EN1Q05925 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EN1Q05925 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EN1Q05925 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EN1Q05925 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EN1Q05925 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
EN1Q05925 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EN1Q05925 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EN1Q05925 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EN1Q05925 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EN1Q05925 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EN1Q05925 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EN1Q05925 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EN1Q05925 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
EN1Q05925 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EN1Q05925 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EN1Q05925 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EN1Q05925 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EN1Q05925 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EN1Q05925 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EN1Q05925 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EN1Q05925 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EN1Q05925 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EN1Q05925 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EN1Q05925 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EN1Q05925 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EN1Q05925 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EN1Q05925 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EN1Q05925 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EN1Q05925 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EN1Q05925 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
EN1Q05925 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EN1Q05925 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EN1Q05925 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EN1Q05925 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EN1Q05925 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EN1Q05925 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EN1Q05925 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EN1Q05925 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EN1Q05925 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EN1Q05925 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EN1Q05925 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EN1Q05925 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EN1Q05925 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
EN1Q05925 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EN1Q05925 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EN1Q05925 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EN1Q05925 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EN1Q05925 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
EN1Q05925 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EN1Q05925 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
EN1Q05925 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
EN1Q05925 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EN1Q05925 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
EN1Q05925 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EN1Q05925 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
EN1Q05925 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
EN1Q05925 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EN1Q05925 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EN1Q05925 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms