Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CAV1Q03135 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CAV1Q03135 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CAV1Q03135 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CAV1Q03135 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CAV1Q03135 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CAV1Q03135 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CAV1Q03135 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CAV1Q03135 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CAV1Q03135 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CAV1Q03135 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CAV1Q03135 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CAV1Q03135 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CAV1Q03135 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CAV1Q03135 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CAV1Q03135 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CAV1Q03135 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CAV1Q03135 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CAV1Q03135 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CAV1Q03135 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CAV1Q03135 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CAV1Q03135 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CAV1Q03135 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CAV1Q03135 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CAV1Q03135 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CAV1Q03135 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CAV1Q03135 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CAV1Q03135 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CAV1Q03135 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CAV1Q03135 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CAV1Q03135 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CAV1Q03135 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms