Protein–RNA interactions for Protein: Q02539

HIST1H1A, Histone H1.1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST1H1AQ02539 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms