Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms