Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBX1P83916 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBX1P83916 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBX1P83916 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBX1P83916 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBX1P83916 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBX1P83916 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBX1P83916 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBX1P83916 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBX1P83916 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBX1P83916 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBX1P83916 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBX1P83916 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBX1P83916 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBX1P83916 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBX1P83916 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBX1P83916 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBX1P83916 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CBX1P83916 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CBX1P83916 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CBX1P83916 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CBX1P83916 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CBX1P83916 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CBX1P83916 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CBX1P83916 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CBX1P83916 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CBX1P83916 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CBX1P83916 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CBX1P83916 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CBX1P83916 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CBX1P83916 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CBX1P83916 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CBX1P83916 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CBX1P83916 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CBX1P83916 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CBX1P83916 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CBX1P83916 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CBX1P83916 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CBX1P83916 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CBX1P83916 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CBX1P83916 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CBX1P83916 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CBX1P83916 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CBX1P83916 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CBX1P83916 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CBX1P83916 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CBX1P83916 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CBX1P83916 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CBX1P83916 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CBX1P83916 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CBX1P83916 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CBX1P83916 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CBX1P83916 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CBX1P83916 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CBX1P83916 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CBX1P83916 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CBX1P83916 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CBX1P83916 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CBX1P83916 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CBX1P83916 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CBX1P83916 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CBX1P83916 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CBX1P83916 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CBX1P83916 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CBX1P83916 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CBX1P83916 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CBX1P83916 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CBX1P83916 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CBX1P83916 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CBX1P83916 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CBX1P83916 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CBX1P83916 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CBX1P83916 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CBX1P83916 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CBX1P83916 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CBX1P83916 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CBX1P83916 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CBX1P83916 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CBX1P83916 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CBX1P83916 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CBX1P83916 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CBX1P83916 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CBX1P83916 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CBX1P83916 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBX1P83916 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBX1P83916 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBX1P83916 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CBX1P83916 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBX1P83916 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBX1P83916 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBX1P83916 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBX1P83916 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBX1P83916 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBX1P83916 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBX1P83916 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBX1P83916 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBX1P83916 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CBX1P83916 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBX1P83916 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBX1P83916 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms