Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HBBP68871 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HBBP68871 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HBBP68871 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HBBP68871 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HBBP68871 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HBBP68871 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HBBP68871 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HBBP68871 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HBBP68871 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HBBP68871 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HBBP68871 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HBBP68871 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HBBP68871 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HBBP68871 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HBBP68871 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HBBP68871 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HBBP68871 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HBBP68871 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HBBP68871 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HBBP68871 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HBBP68871 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HBBP68871 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HBBP68871 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HBBP68871 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HBBP68871 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HBBP68871 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HBBP68871 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HBBP68871 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HBBP68871 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HBBP68871 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HBBP68871 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HBBP68871 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HBBP68871 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HBBP68871 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HBBP68871 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HBBP68871 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HBBP68871 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HBBP68871 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HBBP68871 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HBBP68871 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HBBP68871 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HBBP68871 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HBBP68871 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HBBP68871 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HBBP68871 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HBBP68871 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HBBP68871 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HBBP68871 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HBBP68871 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HBBP68871 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HBBP68871 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HBBP68871 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HBBP68871 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HBBP68871 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HBBP68871 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HBBP68871 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HBBP68871 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HBBP68871 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HBBP68871 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HBBP68871 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HBBP68871 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HBBP68871 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HBBP68871 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HBBP68871 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HBBP68871 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HBBP68871 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HBBP68871 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HBBP68871 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HBBP68871 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HBBP68871 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HBBP68871 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HBBP68871 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HBBP68871 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HBBP68871 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HBBP68871 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HBBP68871 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HBBP68871 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HBBP68871 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HBBP68871 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HBBP68871 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HBBP68871 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HBBP68871 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HBBP68871 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HBBP68871 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HBBP68871 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HBBP68871 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HBBP68871 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HBBP68871 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HBBP68871 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HBBP68871 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HBBP68871 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HBBP68871 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HBBP68871 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HBBP68871 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HBBP68871 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HBBP68871 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HBBP68871 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HBBP68871 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HBBP68871 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms