Protein–RNA interactions for Protein: P62851

RPS25, 40S ribosomal protein S25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS25P62851 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RPS25P62851 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPS25P62851 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPS25P62851 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPS25P62851 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPS25P62851 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPS25P62851 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPS25P62851 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPS25P62851 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPS25P62851 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPS25P62851 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPS25P62851 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPS25P62851 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPS25P62851 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPS25P62851 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPS25P62851 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPS25P62851 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPS25P62851 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPS25P62851 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPS25P62851 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPS25P62851 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RPS25P62851 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPS25P62851 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPS25P62851 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPS25P62851 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RPS25P62851 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPS25P62851 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPS25P62851 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPS25P62851 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPS25P62851 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPS25P62851 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPS25P62851 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPS25P62851 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPS25P62851 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPS25P62851 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPS25P62851 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPS25P62851 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPS25P62851 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPS25P62851 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPS25P62851 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPS25P62851 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPS25P62851 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPS25P62851 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPS25P62851 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPS25P62851 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPS25P62851 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPS25P62851 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPS25P62851 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPS25P62851 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPS25P62851 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPS25P62851 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RPS25P62851 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPS25P62851 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPS25P62851 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPS25P62851 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPS25P62851 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPS25P62851 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPS25P62851 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPS25P62851 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPS25P62851 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPS25P62851 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPS25P62851 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPS25P62851 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPS25P62851 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPS25P62851 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS25P62851 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS25P62851 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS25P62851 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS25P62851 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS25P62851 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS25P62851 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS25P62851 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS25P62851 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS25P62851 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS25P62851 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS25P62851 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS25P62851 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS25P62851 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS25P62851 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS25P62851 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS25P62851 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS25P62851 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS25P62851 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS25P62851 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS25P62851 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS25P62851 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS25P62851 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS25P62851 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS25P62851 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS25P62851 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS25P62851 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS25P62851 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS25P62851 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS25P62851 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS25P62851 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS25P62851 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS25P62851 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS25P62851 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS25P62851 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS25P62851 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms