Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL23P62829 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL23P62829 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL23P62829 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL23P62829 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL23P62829 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL23P62829 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL23P62829 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL23P62829 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL23P62829 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL23P62829 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL23P62829 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL23P62829 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL23P62829 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL23P62829 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL23P62829 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL23P62829 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL23P62829 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL23P62829 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL23P62829 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL23P62829 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL23P62829 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL23P62829 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL23P62829 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL23P62829 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL23P62829 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL23P62829 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL23P62829 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL23P62829 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL23P62829 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL23P62829 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL23P62829 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL23P62829 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL23P62829 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL23P62829 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL23P62829 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL23P62829 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL23P62829 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL23P62829 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL23P62829 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL23P62829 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL23P62829 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RPL23P62829 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RPL23P62829 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL23P62829 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL23P62829 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL23P62829 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL23P62829 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL23P62829 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL23P62829 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL23P62829 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL23P62829 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL23P62829 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL23P62829 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL23P62829 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL23P62829 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL23P62829 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL23P62829 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL23P62829 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL23P62829 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL23P62829 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL23P62829 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL23P62829 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL23P62829 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL23P62829 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL23P62829 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL23P62829 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL23P62829 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL23P62829 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL23P62829 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL23P62829 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL23P62829 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL23P62829 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL23P62829 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL23P62829 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL23P62829 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL23P62829 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL23P62829 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL23P62829 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL23P62829 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL23P62829 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL23P62829 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL23P62829 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL23P62829 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL23P62829 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL23P62829 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL23P62829 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL23P62829 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL23P62829 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL23P62829 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL23P62829 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL23P62829 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL23P62829 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL23P62829 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPL23P62829 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPL23P62829 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPL23P62829 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPL23P62829 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPL23P62829 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPL23P62829 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms