Protein–RNA interactions for Protein: P59044

NLRP6, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP6P59044 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NLRP6P59044 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NLRP6P59044 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NLRP6P59044 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NLRP6P59044 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NLRP6P59044 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NLRP6P59044 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NLRP6P59044 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NLRP6P59044 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NLRP6P59044 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NLRP6P59044 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NLRP6P59044 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NLRP6P59044 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NLRP6P59044 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NLRP6P59044 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NLRP6P59044 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NLRP6P59044 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NLRP6P59044 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NLRP6P59044 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NLRP6P59044 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NLRP6P59044 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NLRP6P59044 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NLRP6P59044 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NLRP6P59044 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NLRP6P59044 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NLRP6P59044 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NLRP6P59044 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NLRP6P59044 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NLRP6P59044 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NLRP6P59044 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NLRP6P59044 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NLRP6P59044 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NLRP6P59044 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NLRP6P59044 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NLRP6P59044 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NLRP6P59044 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NLRP6P59044 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NLRP6P59044 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NLRP6P59044 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NLRP6P59044 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NLRP6P59044 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NLRP6P59044 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NLRP6P59044 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NLRP6P59044 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NLRP6P59044 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NLRP6P59044 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NLRP6P59044 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
NLRP6P59044 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NLRP6P59044 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NLRP6P59044 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NLRP6P59044 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NLRP6P59044 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NLRP6P59044 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NLRP6P59044 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NLRP6P59044 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NLRP6P59044 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NLRP6P59044 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NLRP6P59044 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NLRP6P59044 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NLRP6P59044 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NLRP6P59044 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NLRP6P59044 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NLRP6P59044 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NLRP6P59044 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NLRP6P59044 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NLRP6P59044 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NLRP6P59044 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms