Protein–RNA interactions for Protein: P54107

CRISP1, Cysteine-rich secretory protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP1P54107 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRISP1P54107 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms