Protein–RNA interactions for Protein: P51160

PDE6C, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6CP51160 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms