Protein–RNA interactions for Protein: P46019

PHKA2, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, liver isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKA2P46019 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHKA2P46019 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHKA2P46019 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHKA2P46019 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHKA2P46019 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHKA2P46019 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHKA2P46019 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHKA2P46019 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PHKA2P46019 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHKA2P46019 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHKA2P46019 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHKA2P46019 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHKA2P46019 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHKA2P46019 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHKA2P46019 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHKA2P46019 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHKA2P46019 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PHKA2P46019 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHKA2P46019 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHKA2P46019 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHKA2P46019 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHKA2P46019 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHKA2P46019 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHKA2P46019 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHKA2P46019 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHKA2P46019 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHKA2P46019 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHKA2P46019 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHKA2P46019 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHKA2P46019 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHKA2P46019 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PHKA2P46019 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHKA2P46019 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHKA2P46019 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PHKA2P46019 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHKA2P46019 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHKA2P46019 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHKA2P46019 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHKA2P46019 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHKA2P46019 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHKA2P46019 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHKA2P46019 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PHKA2P46019 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHKA2P46019 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHKA2P46019 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHKA2P46019 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHKA2P46019 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHKA2P46019 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHKA2P46019 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHKA2P46019 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
PHKA2P46019 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PHKA2P46019 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHKA2P46019 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHKA2P46019 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHKA2P46019 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHKA2P46019 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHKA2P46019 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PHKA2P46019 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHKA2P46019 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHKA2P46019 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHKA2P46019 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHKA2P46019 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHKA2P46019 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHKA2P46019 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHKA2P46019 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHKA2P46019 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHKA2P46019 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHKA2P46019 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHKA2P46019 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHKA2P46019 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHKA2P46019 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHKA2P46019 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHKA2P46019 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHKA2P46019 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHKA2P46019 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PHKA2P46019 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHKA2P46019 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHKA2P46019 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHKA2P46019 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHKA2P46019 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHKA2P46019 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHKA2P46019 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHKA2P46019 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHKA2P46019 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHKA2P46019 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PHKA2P46019 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHKA2P46019 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHKA2P46019 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHKA2P46019 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PHKA2P46019 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PHKA2P46019 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHKA2P46019 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHKA2P46019 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHKA2P46019 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHKA2P46019 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHKA2P46019 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHKA2P46019 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHKA2P46019 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHKA2P46019 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHKA2P46019 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms