Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GRIA2P42262 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GRIA2P42262 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GRIA2P42262 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GRIA2P42262 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GRIA2P42262 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIA2P42262 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIA2P42262 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIA2P42262 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIA2P42262 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIA2P42262 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIA2P42262 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIA2P42262 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIA2P42262 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIA2P42262 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIA2P42262 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIA2P42262 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIA2P42262 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIA2P42262 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIA2P42262 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIA2P42262 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIA2P42262 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIA2P42262 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIA2P42262 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIA2P42262 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIA2P42262 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIA2P42262 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIA2P42262 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIA2P42262 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIA2P42262 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIA2P42262 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIA2P42262 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIA2P42262 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIA2P42262 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIA2P42262 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIA2P42262 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIA2P42262 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIA2P42262 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIA2P42262 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIA2P42262 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIA2P42262 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIA2P42262 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIA2P42262 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIA2P42262 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIA2P42262 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIA2P42262 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIA2P42262 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIA2P42262 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIA2P42262 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIA2P42262 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIA2P42262 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIA2P42262 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIA2P42262 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIA2P42262 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIA2P42262 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIA2P42262 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIA2P42262 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIA2P42262 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIA2P42262 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIA2P42262 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIA2P42262 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIA2P42262 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIA2P42262 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIA2P42262 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIA2P42262 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIA2P42262 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIA2P42262 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIA2P42262 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms