Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MLH1P40692 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MLH1P40692 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MLH1P40692 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MLH1P40692 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MLH1P40692 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MLH1P40692 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MLH1P40692 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MLH1P40692 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MLH1P40692 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MLH1P40692 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MLH1P40692 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MLH1P40692 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MLH1P40692 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MLH1P40692 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MLH1P40692 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MLH1P40692 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MLH1P40692 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MLH1P40692 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MLH1P40692 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MLH1P40692 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MLH1P40692 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MLH1P40692 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MLH1P40692 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MLH1P40692 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MLH1P40692 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MLH1P40692 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MLH1P40692 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MLH1P40692 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MLH1P40692 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MLH1P40692 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MLH1P40692 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MLH1P40692 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MLH1P40692 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MLH1P40692 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MLH1P40692 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MLH1P40692 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MLH1P40692 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MLH1P40692 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MLH1P40692 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MLH1P40692 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MLH1P40692 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MLH1P40692 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MLH1P40692 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MLH1P40692 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MLH1P40692 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MLH1P40692 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MLH1P40692 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MLH1P40692 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MLH1P40692 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MLH1P40692 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MLH1P40692 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MLH1P40692 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MLH1P40692 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MLH1P40692 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MLH1P40692 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MLH1P40692 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MLH1P40692 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MLH1P40692 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MLH1P40692 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MLH1P40692 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MLH1P40692 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MLH1P40692 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MLH1P40692 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MLH1P40692 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MLH1P40692 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MLH1P40692 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MLH1P40692 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MLH1P40692 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MLH1P40692 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MLH1P40692 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MLH1P40692 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MLH1P40692 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MLH1P40692 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MLH1P40692 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MLH1P40692 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MLH1P40692 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MLH1P40692 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MLH1P40692 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MLH1P40692 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MLH1P40692 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MLH1P40692 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MLH1P40692 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MLH1P40692 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MLH1P40692 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MLH1P40692 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MLH1P40692 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MLH1P40692 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MLH1P40692 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MLH1P40692 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MLH1P40692 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MLH1P40692 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MLH1P40692 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MLH1P40692 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MLH1P40692 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MLH1P40692 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MLH1P40692 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MLH1P40692 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MLH1P40692 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MLH1P40692 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms