Protein–RNA interactions for Protein: P35241

RDX, Radixin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDXP35241 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RDXP35241 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RDXP35241 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RDXP35241 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RDXP35241 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RDXP35241 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RDXP35241 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RDXP35241 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RDXP35241 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RDXP35241 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RDXP35241 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RDXP35241 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RDXP35241 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RDXP35241 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RDXP35241 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RDXP35241 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RDXP35241 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RDXP35241 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RDXP35241 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RDXP35241 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RDXP35241 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RDXP35241 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RDXP35241 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RDXP35241 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RDXP35241 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RDXP35241 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RDXP35241 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RDXP35241 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RDXP35241 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RDXP35241 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RDXP35241 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RDXP35241 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RDXP35241 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RDXP35241 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RDXP35241 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RDXP35241 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RDXP35241 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RDXP35241 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RDXP35241 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RDXP35241 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RDXP35241 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RDXP35241 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RDXP35241 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RDXP35241 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RDXP35241 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RDXP35241 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RDXP35241 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RDXP35241 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RDXP35241 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RDXP35241 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RDXP35241 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RDXP35241 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RDXP35241 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RDXP35241 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RDXP35241 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RDXP35241 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RDXP35241 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RDXP35241 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RDXP35241 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RDXP35241 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RDXP35241 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RDXP35241 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RDXP35241 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RDXP35241 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RDXP35241 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RDXP35241 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RDXP35241 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RDXP35241 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RDXP35241 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RDXP35241 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RDXP35241 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RDXP35241 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RDXP35241 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RDXP35241 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RDXP35241 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RDXP35241 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RDXP35241 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RDXP35241 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RDXP35241 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RDXP35241 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RDXP35241 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RDXP35241 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RDXP35241 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RDXP35241 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RDXP35241 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RDXP35241 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RDXP35241 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RDXP35241 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RDXP35241 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RDXP35241 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RDXP35241 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RDXP35241 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RDXP35241 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RDXP35241 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RDXP35241 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RDXP35241 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RDXP35241 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RDXP35241 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RDXP35241 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RDXP35241 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms