Protein–RNA interactions for Protein: P33261

CYP2C19, Cytochrome P450 2C19, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C19P33261 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYP2C19P33261 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYP2C19P33261 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYP2C19P33261 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYP2C19P33261 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYP2C19P33261 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYP2C19P33261 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYP2C19P33261 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYP2C19P33261 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYP2C19P33261 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYP2C19P33261 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYP2C19P33261 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYP2C19P33261 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYP2C19P33261 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYP2C19P33261 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CYP2C19P33261 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYP2C19P33261 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CYP2C19P33261 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYP2C19P33261 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYP2C19P33261 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYP2C19P33261 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYP2C19P33261 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYP2C19P33261 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYP2C19P33261 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYP2C19P33261 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYP2C19P33261 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYP2C19P33261 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYP2C19P33261 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYP2C19P33261 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYP2C19P33261 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYP2C19P33261 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYP2C19P33261 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYP2C19P33261 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYP2C19P33261 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYP2C19P33261 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYP2C19P33261 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYP2C19P33261 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYP2C19P33261 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYP2C19P33261 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYP2C19P33261 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYP2C19P33261 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYP2C19P33261 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYP2C19P33261 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYP2C19P33261 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYP2C19P33261 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CYP2C19P33261 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYP2C19P33261 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYP2C19P33261 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYP2C19P33261 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYP2C19P33261 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYP2C19P33261 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYP2C19P33261 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYP2C19P33261 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYP2C19P33261 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYP2C19P33261 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CYP2C19P33261 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYP2C19P33261 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CYP2C19P33261 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYP2C19P33261 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYP2C19P33261 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CYP2C19P33261 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYP2C19P33261 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYP2C19P33261 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYP2C19P33261 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYP2C19P33261 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYP2C19P33261 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYP2C19P33261 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYP2C19P33261 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYP2C19P33261 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYP2C19P33261 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYP2C19P33261 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYP2C19P33261 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYP2C19P33261 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYP2C19P33261 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYP2C19P33261 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYP2C19P33261 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYP2C19P33261 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYP2C19P33261 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYP2C19P33261 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYP2C19P33261 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CYP2C19P33261 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYP2C19P33261 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CYP2C19P33261 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYP2C19P33261 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYP2C19P33261 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYP2C19P33261 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYP2C19P33261 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYP2C19P33261 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYP2C19P33261 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYP2C19P33261 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYP2C19P33261 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYP2C19P33261 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYP2C19P33261 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYP2C19P33261 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYP2C19P33261 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYP2C19P33261 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYP2C19P33261 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYP2C19P33261 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYP2C19P33261 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYP2C19P33261 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms