Protein–RNA interactions for Protein: P32456

GBP2, Guanylate-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP2P32456 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBP2P32456 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GBP2P32456 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBP2P32456 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBP2P32456 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBP2P32456 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBP2P32456 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBP2P32456 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBP2P32456 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBP2P32456 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP2P32456 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP2P32456 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP2P32456 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP2P32456 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP2P32456 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP2P32456 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP2P32456 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP2P32456 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP2P32456 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP2P32456 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP2P32456 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP2P32456 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP2P32456 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP2P32456 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP2P32456 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP2P32456 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP2P32456 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP2P32456 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP2P32456 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP2P32456 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP2P32456 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP2P32456 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP2P32456 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP2P32456 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP2P32456 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP2P32456 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP2P32456 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP2P32456 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP2P32456 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP2P32456 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP2P32456 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP2P32456 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP2P32456 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP2P32456 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP2P32456 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP2P32456 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP2P32456 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP2P32456 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP2P32456 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP2P32456 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP2P32456 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP2P32456 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP2P32456 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP2P32456 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP2P32456 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP2P32456 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP2P32456 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP2P32456 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP2P32456 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP2P32456 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP2P32456 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP2P32456 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP2P32456 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP2P32456 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP2P32456 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP2P32456 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP2P32456 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP2P32456 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP2P32456 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP2P32456 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP2P32456 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP2P32456 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP2P32456 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP2P32456 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP2P32456 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP2P32456 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP2P32456 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP2P32456 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP2P32456 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP2P32456 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP2P32456 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GBP2P32456 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GBP2P32456 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GBP2P32456 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GBP2P32456 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GBP2P32456 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GBP2P32456 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GBP2P32456 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GBP2P32456 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GBP2P32456 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GBP2P32456 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GBP2P32456 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GBP2P32456 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GBP2P32456 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GBP2P32456 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBP2P32456 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBP2P32456 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBP2P32456 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBP2P32456 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBP2P32456 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms