Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GCAP28676 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
GCAP28676 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
GCAP28676 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
GCAP28676 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
GCAP28676 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GCAP28676 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GCAP28676 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GCAP28676 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GCAP28676 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GCAP28676 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GCAP28676 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GCAP28676 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GCAP28676 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GCAP28676 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GCAP28676 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GCAP28676 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GCAP28676 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GCAP28676 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GCAP28676 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GCAP28676 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GCAP28676 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GCAP28676 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCAP28676 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCAP28676 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCAP28676 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GCAP28676 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCAP28676 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCAP28676 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCAP28676 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCAP28676 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCAP28676 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCAP28676 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCAP28676 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCAP28676 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCAP28676 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCAP28676 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCAP28676 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCAP28676 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCAP28676 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GCAP28676 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCAP28676 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCAP28676 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCAP28676 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCAP28676 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCAP28676 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCAP28676 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCAP28676 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCAP28676 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCAP28676 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCAP28676 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCAP28676 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCAP28676 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCAP28676 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCAP28676 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCAP28676 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCAP28676 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCAP28676 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCAP28676 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GCAP28676 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCAP28676 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCAP28676 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCAP28676 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCAP28676 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCAP28676 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCAP28676 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCAP28676 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCAP28676 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCAP28676 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCAP28676 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCAP28676 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCAP28676 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCAP28676 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCAP28676 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCAP28676 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCAP28676 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCAP28676 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCAP28676 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCAP28676 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCAP28676 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCAP28676 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCAP28676 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCAP28676 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCAP28676 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCAP28676 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCAP28676 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCAP28676 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCAP28676 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCAP28676 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCAP28676 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCAP28676 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCAP28676 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCAP28676 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCAP28676 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCAP28676 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GCAP28676 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCAP28676 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCAP28676 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCAP28676 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCAP28676 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms