Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
DNMT1P26358 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
DNMT1P26358 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
DNMT1P26358 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
DNMT1P26358 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
DNMT1P26358 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
DNMT1P26358 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
DNMT1P26358 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
DNMT1P26358 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
DNMT1P26358 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
DNMT1P26358 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
DNMT1P26358 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
DNMT1P26358 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
DNMT1P26358 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
DNMT1P26358 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
DNMT1P26358 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
DNMT1P26358 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
DNMT1P26358 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
DNMT1P26358 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
DNMT1P26358 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
DNMT1P26358 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
DNMT1P26358 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
DNMT1P26358 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
DNMT1P26358 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
DNMT1P26358 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
DNMT1P26358 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
DNMT1P26358 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
DNMT1P26358 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
DNMT1P26358 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
DNMT1P26358 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
DNMT1P26358 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
DNMT1P26358 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
DNMT1P26358 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
DNMT1P26358 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
DNMT1P26358 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
DNMT1P26358 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
DNMT1P26358 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
DNMT1P26358 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
DNMT1P26358 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
DNMT1P26358 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
DNMT1P26358 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
DNMT1P26358 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC30.84■■■□□ 2.53
DNMT1P26358 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
DNMT1P26358 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
DNMT1P26358 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
DNMT1P26358 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
DNMT1P26358 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
DNMT1P26358 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
DNMT1P26358 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
DNMT1P26358 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
DNMT1P26358 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
DNMT1P26358 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
DNMT1P26358 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
DNMT1P26358 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
DNMT1P26358 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
DNMT1P26358 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
DNMT1P26358 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
DNMT1P26358 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
DNMT1P26358 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
DNMT1P26358 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
DNMT1P26358 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
DNMT1P26358 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
DNMT1P26358 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
DNMT1P26358 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
DNMT1P26358 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
DNMT1P26358 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
DNMT1P26358 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
DNMT1P26358 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
DNMT1P26358 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
DNMT1P26358 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
DNMT1P26358 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
DNMT1P26358 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
DNMT1P26358 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
DNMT1P26358 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
DNMT1P26358 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
DNMT1P26358 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
DNMT1P26358 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
DNMT1P26358 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
DNMT1P26358 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
DNMT1P26358 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
DNMT1P26358 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
DNMT1P26358 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
DNMT1P26358 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
DNMT1P26358 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
DNMT1P26358 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC30.8■■■□□ 2.52
DNMT1P26358 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
DNMT1P26358 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
DNMT1P26358 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
DNMT1P26358 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
DNMT1P26358 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
DNMT1P26358 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
DNMT1P26358 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
DNMT1P26358 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
DNMT1P26358 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
DNMT1P26358 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
DNMT1P26358 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
DNMT1P26358 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
DNMT1P26358 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
DNMT1P26358 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
DNMT1P26358 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms