Protein–RNA interactions for Protein: P25490

YY1, Transcriptional repressor protein YY1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YY1P25490 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
YY1P25490 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
YY1P25490 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
YY1P25490 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
YY1P25490 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
YY1P25490 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
YY1P25490 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
YY1P25490 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
YY1P25490 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
YY1P25490 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
YY1P25490 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
YY1P25490 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
YY1P25490 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
YY1P25490 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
YY1P25490 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
YY1P25490 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
YY1P25490 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
YY1P25490 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
YY1P25490 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
YY1P25490 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
YY1P25490 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
YY1P25490 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
YY1P25490 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
YY1P25490 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
YY1P25490 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
YY1P25490 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
YY1P25490 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
YY1P25490 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
YY1P25490 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
YY1P25490 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
YY1P25490 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
YY1P25490 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
YY1P25490 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
YY1P25490 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
YY1P25490 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
YY1P25490 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
YY1P25490 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
YY1P25490 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
YY1P25490 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
YY1P25490 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
YY1P25490 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
YY1P25490 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
YY1P25490 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
YY1P25490 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
YY1P25490 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
YY1P25490 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
YY1P25490 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
YY1P25490 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
YY1P25490 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
YY1P25490 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
YY1P25490 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
YY1P25490 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
YY1P25490 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
YY1P25490 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
YY1P25490 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
YY1P25490 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
YY1P25490 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
YY1P25490 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
YY1P25490 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
YY1P25490 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
YY1P25490 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
YY1P25490 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
YY1P25490 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
YY1P25490 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
YY1P25490 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
YY1P25490 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
YY1P25490 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
YY1P25490 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
YY1P25490 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
YY1P25490 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
YY1P25490 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
YY1P25490 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
YY1P25490 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
YY1P25490 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
YY1P25490 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
YY1P25490 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
YY1P25490 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
YY1P25490 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
YY1P25490 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
YY1P25490 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
YY1P25490 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
YY1P25490 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
YY1P25490 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
YY1P25490 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
YY1P25490 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
YY1P25490 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
YY1P25490 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
YY1P25490 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
YY1P25490 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
YY1P25490 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
YY1P25490 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
YY1P25490 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
YY1P25490 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
YY1P25490 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
YY1P25490 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
YY1P25490 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
YY1P25490 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
YY1P25490 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
YY1P25490 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
YY1P25490 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms