Protein–RNA interactions for Protein: P20337

RAB3B, Ras-related protein Rab-3B, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3BP20337 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
RAB3BP20337 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB3BP20337 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms