Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
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