Protein–RNA interactions for Protein: P15336

ATF2, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-2, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF2P15336 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF2P15336 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF2P15336 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF2P15336 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF2P15336 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF2P15336 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF2P15336 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF2P15336 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF2P15336 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF2P15336 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF2P15336 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF2P15336 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF2P15336 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF2P15336 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF2P15336 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF2P15336 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF2P15336 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF2P15336 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF2P15336 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF2P15336 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF2P15336 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF2P15336 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF2P15336 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF2P15336 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF2P15336 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF2P15336 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF2P15336 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF2P15336 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF2P15336 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF2P15336 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF2P15336 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF2P15336 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF2P15336 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF2P15336 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF2P15336 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF2P15336 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF2P15336 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF2P15336 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF2P15336 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF2P15336 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF2P15336 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF2P15336 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF2P15336 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF2P15336 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF2P15336 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF2P15336 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF2P15336 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF2P15336 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF2P15336 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF2P15336 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF2P15336 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF2P15336 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF2P15336 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF2P15336 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF2P15336 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF2P15336 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF2P15336 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF2P15336 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF2P15336 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF2P15336 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF2P15336 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF2P15336 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF2P15336 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF2P15336 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF2P15336 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF2P15336 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF2P15336 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF2P15336 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF2P15336 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF2P15336 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF2P15336 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF2P15336 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF2P15336 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF2P15336 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF2P15336 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF2P15336 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATF2P15336 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATF2P15336 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATF2P15336 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATF2P15336 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATF2P15336 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATF2P15336 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATF2P15336 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
ATF2P15336 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ATF2P15336 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ATF2P15336 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATF2P15336 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATF2P15336 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATF2P15336 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATF2P15336 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATF2P15336 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATF2P15336 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATF2P15336 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATF2P15336 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATF2P15336 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATF2P15336 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATF2P15336 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATF2P15336 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATF2P15336 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATF2P15336 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms