Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LYL1P12980 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LYL1P12980 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LYL1P12980 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LYL1P12980 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LYL1P12980 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LYL1P12980 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LYL1P12980 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LYL1P12980 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LYL1P12980 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LYL1P12980 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LYL1P12980 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LYL1P12980 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LYL1P12980 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LYL1P12980 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LYL1P12980 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LYL1P12980 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LYL1P12980 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LYL1P12980 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LYL1P12980 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LYL1P12980 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LYL1P12980 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LYL1P12980 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LYL1P12980 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LYL1P12980 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LYL1P12980 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LYL1P12980 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LYL1P12980 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LYL1P12980 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LYL1P12980 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LYL1P12980 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LYL1P12980 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LYL1P12980 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LYL1P12980 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LYL1P12980 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LYL1P12980 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LYL1P12980 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LYL1P12980 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LYL1P12980 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LYL1P12980 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LYL1P12980 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LYL1P12980 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LYL1P12980 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LYL1P12980 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LYL1P12980 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LYL1P12980 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LYL1P12980 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LYL1P12980 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LYL1P12980 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LYL1P12980 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LYL1P12980 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LYL1P12980 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LYL1P12980 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LYL1P12980 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LYL1P12980 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LYL1P12980 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LYL1P12980 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LYL1P12980 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LYL1P12980 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LYL1P12980 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LYL1P12980 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LYL1P12980 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LYL1P12980 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LYL1P12980 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LYL1P12980 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LYL1P12980 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LYL1P12980 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LYL1P12980 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LYL1P12980 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LYL1P12980 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LYL1P12980 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LYL1P12980 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LYL1P12980 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LYL1P12980 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LYL1P12980 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LYL1P12980 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LYL1P12980 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LYL1P12980 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LYL1P12980 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LYL1P12980 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LYL1P12980 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LYL1P12980 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LYL1P12980 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LYL1P12980 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LYL1P12980 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LYL1P12980 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LYL1P12980 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LYL1P12980 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LYL1P12980 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LYL1P12980 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LYL1P12980 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LYL1P12980 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LYL1P12980 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LYL1P12980 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LYL1P12980 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LYL1P12980 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LYL1P12980 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LYL1P12980 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LYL1P12980 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LYL1P12980 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms