Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms