Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI8

SAA1, Serum amyloid A-1 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA1P0DJI8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SAA1P0DJI8 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAA1P0DJI8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAA1P0DJI8 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAA1P0DJI8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAA1P0DJI8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAA1P0DJI8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAA1P0DJI8 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAA1P0DJI8 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SAA1P0DJI8 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAA1P0DJI8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAA1P0DJI8 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAA1P0DJI8 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SAA1P0DJI8 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAA1P0DJI8 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAA1P0DJI8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAA1P0DJI8 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAA1P0DJI8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAA1P0DJI8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAA1P0DJI8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAA1P0DJI8 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAA1P0DJI8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SAA1P0DJI8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SAA1P0DJI8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAA1P0DJI8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAA1P0DJI8 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAA1P0DJI8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAA1P0DJI8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAA1P0DJI8 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAA1P0DJI8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAA1P0DJI8 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAA1P0DJI8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAA1P0DJI8 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAA1P0DJI8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAA1P0DJI8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAA1P0DJI8 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAA1P0DJI8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAA1P0DJI8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAA1P0DJI8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAA1P0DJI8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SAA1P0DJI8 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAA1P0DJI8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAA1P0DJI8 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SAA1P0DJI8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAA1P0DJI8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAA1P0DJI8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAA1P0DJI8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAA1P0DJI8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAA1P0DJI8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAA1P0DJI8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAA1P0DJI8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAA1P0DJI8 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAA1P0DJI8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAA1P0DJI8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SAA1P0DJI8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAA1P0DJI8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAA1P0DJI8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAA1P0DJI8 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAA1P0DJI8 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAA1P0DJI8 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAA1P0DJI8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAA1P0DJI8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAA1P0DJI8 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAA1P0DJI8 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAA1P0DJI8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAA1P0DJI8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SAA1P0DJI8 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAA1P0DJI8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAA1P0DJI8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAA1P0DJI8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAA1P0DJI8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAA1P0DJI8 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAA1P0DJI8 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms