Protein–RNA interactions for Protein: P0DI80

SMIM6, Small integral membrane protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM6P0DI80 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms