Protein–RNA interactions for Protein: P07498

CSN3, Kappa-casein, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN3P07498 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSN3P07498 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSN3P07498 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSN3P07498 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSN3P07498 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSN3P07498 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CSN3P07498 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSN3P07498 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSN3P07498 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CSN3P07498 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSN3P07498 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSN3P07498 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSN3P07498 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSN3P07498 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSN3P07498 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSN3P07498 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSN3P07498 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSN3P07498 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSN3P07498 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSN3P07498 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSN3P07498 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSN3P07498 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSN3P07498 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSN3P07498 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSN3P07498 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSN3P07498 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSN3P07498 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CSN3P07498 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CSN3P07498 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSN3P07498 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSN3P07498 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CSN3P07498 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CSN3P07498 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSN3P07498 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSN3P07498 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSN3P07498 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSN3P07498 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSN3P07498 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSN3P07498 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSN3P07498 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSN3P07498 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSN3P07498 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSN3P07498 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CSN3P07498 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSN3P07498 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CSN3P07498 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSN3P07498 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CSN3P07498 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSN3P07498 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSN3P07498 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CSN3P07498 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CSN3P07498 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CSN3P07498 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CSN3P07498 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CSN3P07498 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CSN3P07498 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CSN3P07498 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CSN3P07498 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSN3P07498 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CSN3P07498 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSN3P07498 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CSN3P07498 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSN3P07498 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSN3P07498 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSN3P07498 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CSN3P07498 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSN3P07498 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSN3P07498 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSN3P07498 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSN3P07498 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSN3P07498 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSN3P07498 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSN3P07498 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSN3P07498 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSN3P07498 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSN3P07498 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSN3P07498 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSN3P07498 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CSN3P07498 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSN3P07498 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSN3P07498 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CSN3P07498 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSN3P07498 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSN3P07498 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSN3P07498 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSN3P07498 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSN3P07498 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSN3P07498 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSN3P07498 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSN3P07498 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSN3P07498 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSN3P07498 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSN3P07498 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSN3P07498 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSN3P07498 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSN3P07498 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSN3P07498 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSN3P07498 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSN3P07498 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CSN3P07498 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms