Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CENPBP07199 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CENPBP07199 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CENPBP07199 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CENPBP07199 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CENPBP07199 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CENPBP07199 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CENPBP07199 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CENPBP07199 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CENPBP07199 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CENPBP07199 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CENPBP07199 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CENPBP07199 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CENPBP07199 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CENPBP07199 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CENPBP07199 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CENPBP07199 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CENPBP07199 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CENPBP07199 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CENPBP07199 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CENPBP07199 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CENPBP07199 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CENPBP07199 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CENPBP07199 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CENPBP07199 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CENPBP07199 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CENPBP07199 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CENPBP07199 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CENPBP07199 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CENPBP07199 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CENPBP07199 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CENPBP07199 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CENPBP07199 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CENPBP07199 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CENPBP07199 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CENPBP07199 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CENPBP07199 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CENPBP07199 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CENPBP07199 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CENPBP07199 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CENPBP07199 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CENPBP07199 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CENPBP07199 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CENPBP07199 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CENPBP07199 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CENPBP07199 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CENPBP07199 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CENPBP07199 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CENPBP07199 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CENPBP07199 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CENPBP07199 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CENPBP07199 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CENPBP07199 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CENPBP07199 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CENPBP07199 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CENPBP07199 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CENPBP07199 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CENPBP07199 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CENPBP07199 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CENPBP07199 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CENPBP07199 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CENPBP07199 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CENPBP07199 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CENPBP07199 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CENPBP07199 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CENPBP07199 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CENPBP07199 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CENPBP07199 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CENPBP07199 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CENPBP07199 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CENPBP07199 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CENPBP07199 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CENPBP07199 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CENPBP07199 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CENPBP07199 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CENPBP07199 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CENPBP07199 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CENPBP07199 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CENPBP07199 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CENPBP07199 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CENPBP07199 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CENPBP07199 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CENPBP07199 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CENPBP07199 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CENPBP07199 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CENPBP07199 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CENPBP07199 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CENPBP07199 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CENPBP07199 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CENPBP07199 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CENPBP07199 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CENPBP07199 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CENPBP07199 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CENPBP07199 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CENPBP07199 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CENPBP07199 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CENPBP07199 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CENPBP07199 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CENPBP07199 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CENPBP07199 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms