Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
POP4O95707 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
POP4O95707 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
POP4O95707 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
POP4O95707 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
POP4O95707 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
POP4O95707 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POP4O95707 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POP4O95707 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POP4O95707 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POP4O95707 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POP4O95707 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POP4O95707 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POP4O95707 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POP4O95707 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POP4O95707 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POP4O95707 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POP4O95707 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POP4O95707 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POP4O95707 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POP4O95707 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POP4O95707 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POP4O95707 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POP4O95707 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POP4O95707 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POP4O95707 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POP4O95707 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POP4O95707 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POP4O95707 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POP4O95707 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POP4O95707 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
POP4O95707 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POP4O95707 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
POP4O95707 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POP4O95707 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POP4O95707 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POP4O95707 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POP4O95707 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POP4O95707 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POP4O95707 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POP4O95707 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POP4O95707 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POP4O95707 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POP4O95707 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POP4O95707 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POP4O95707 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POP4O95707 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POP4O95707 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POP4O95707 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POP4O95707 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POP4O95707 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POP4O95707 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POP4O95707 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POP4O95707 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POP4O95707 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POP4O95707 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POP4O95707 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POP4O95707 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POP4O95707 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POP4O95707 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POP4O95707 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POP4O95707 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POP4O95707 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POP4O95707 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POP4O95707 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POP4O95707 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POP4O95707 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POP4O95707 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POP4O95707 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POP4O95707 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POP4O95707 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POP4O95707 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POP4O95707 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POP4O95707 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POP4O95707 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POP4O95707 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POP4O95707 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POP4O95707 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POP4O95707 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POP4O95707 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
POP4O95707 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POP4O95707 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POP4O95707 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POP4O95707 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POP4O95707 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POP4O95707 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POP4O95707 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POP4O95707 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POP4O95707 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POP4O95707 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POP4O95707 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POP4O95707 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POP4O95707 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POP4O95707 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POP4O95707 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POP4O95707 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POP4O95707 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POP4O95707 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POP4O95707 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POP4O95707 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 208.8 ms