Protein–RNA interactions for Protein: O75534

CSDE1, Cold shock domain-containing protein E1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1O75534 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms