Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SIN3BO75182 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SIN3BO75182 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SIN3BO75182 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SIN3BO75182 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIN3BO75182 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIN3BO75182 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIN3BO75182 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIN3BO75182 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIN3BO75182 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIN3BO75182 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIN3BO75182 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIN3BO75182 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIN3BO75182 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIN3BO75182 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIN3BO75182 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIN3BO75182 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIN3BO75182 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIN3BO75182 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIN3BO75182 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIN3BO75182 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIN3BO75182 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIN3BO75182 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIN3BO75182 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SIN3BO75182 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SIN3BO75182 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SIN3BO75182 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SIN3BO75182 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SIN3BO75182 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SIN3BO75182 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
SIN3BO75182 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SIN3BO75182 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SIN3BO75182 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms