Protein–RNA interactions for Protein: O75113

N4BP1, NEDD4-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 896 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP1O75113 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
N4BP1O75113 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
N4BP1O75113 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
N4BP1O75113 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
N4BP1O75113 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
N4BP1O75113 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
N4BP1O75113 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
N4BP1O75113 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
N4BP1O75113 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
N4BP1O75113 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
N4BP1O75113 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
N4BP1O75113 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
N4BP1O75113 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
N4BP1O75113 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
N4BP1O75113 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
N4BP1O75113 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
N4BP1O75113 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
N4BP1O75113 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
N4BP1O75113 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
N4BP1O75113 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
N4BP1O75113 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
N4BP1O75113 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
N4BP1O75113 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
N4BP1O75113 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
N4BP1O75113 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
N4BP1O75113 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
N4BP1O75113 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
N4BP1O75113 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms