Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms