Protein–RNA interactions for Protein: O43716

GATC, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATCO43716 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATCO43716 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATCO43716 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATCO43716 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATCO43716 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATCO43716 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATCO43716 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATCO43716 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATCO43716 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATCO43716 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATCO43716 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATCO43716 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATCO43716 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATCO43716 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATCO43716 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GATCO43716 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATCO43716 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATCO43716 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATCO43716 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATCO43716 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATCO43716 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATCO43716 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATCO43716 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GATCO43716 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GATCO43716 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GATCO43716 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GATCO43716 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GATCO43716 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GATCO43716 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GATCO43716 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GATCO43716 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GATCO43716 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GATCO43716 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GATCO43716 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GATCO43716 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GATCO43716 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GATCO43716 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GATCO43716 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GATCO43716 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GATCO43716 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GATCO43716 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GATCO43716 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GATCO43716 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GATCO43716 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GATCO43716 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GATCO43716 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GATCO43716 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GATCO43716 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GATCO43716 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GATCO43716 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GATCO43716 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GATCO43716 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GATCO43716 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GATCO43716 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GATCO43716 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GATCO43716 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GATCO43716 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GATCO43716 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GATCO43716 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GATCO43716 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GATCO43716 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GATCO43716 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GATCO43716 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GATCO43716 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GATCO43716 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GATCO43716 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GATCO43716 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GATCO43716 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GATCO43716 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GATCO43716 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GATCO43716 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GATCO43716 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GATCO43716 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GATCO43716 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GATCO43716 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GATCO43716 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GATCO43716 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GATCO43716 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GATCO43716 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GATCO43716 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GATCO43716 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GATCO43716 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GATCO43716 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GATCO43716 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GATCO43716 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GATCO43716 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GATCO43716 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GATCO43716 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GATCO43716 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GATCO43716 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GATCO43716 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GATCO43716 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GATCO43716 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GATCO43716 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GATCO43716 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GATCO43716 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GATCO43716 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GATCO43716 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GATCO43716 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GATCO43716 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms