Protein–RNA interactions for Protein: O43593

HR, Lysine-specific demethylase hairless, humanhuman

Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRO43593 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HRO43593 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HRO43593 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HRO43593 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HRO43593 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HRO43593 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HRO43593 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HRO43593 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HRO43593 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HRO43593 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HRO43593 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HRO43593 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HRO43593 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HRO43593 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HRO43593 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HRO43593 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HRO43593 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HRO43593 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HRO43593 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HRO43593 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HRO43593 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HRO43593 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HRO43593 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HRO43593 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HRO43593 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HRO43593 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HRO43593 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HRO43593 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HRO43593 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HRO43593 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HRO43593 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HRO43593 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HRO43593 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HRO43593 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HRO43593 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HRO43593 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HRO43593 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HRO43593 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HRO43593 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HRO43593 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HRO43593 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HRO43593 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HRO43593 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HRO43593 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HRO43593 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HRO43593 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HRO43593 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HRO43593 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HRO43593 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HRO43593 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HRO43593 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HRO43593 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HRO43593 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HRO43593 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HRO43593 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HRO43593 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HRO43593 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HRO43593 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HRO43593 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HRO43593 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HRO43593 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HRO43593 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HRO43593 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HRO43593 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HRO43593 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HRO43593 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HRO43593 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HRO43593 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HRO43593 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HRO43593 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HRO43593 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HRO43593 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HRO43593 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HRO43593 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HRO43593 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HRO43593 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HRO43593 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HRO43593 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HRO43593 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HRO43593 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HRO43593 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HRO43593 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HRO43593 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HRO43593 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HRO43593 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HRO43593 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HRO43593 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HRO43593 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HRO43593 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HRO43593 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HRO43593 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HRO43593 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HRO43593 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HRO43593 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HRO43593 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HRO43593 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HRO43593 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HRO43593 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HRO43593 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HRO43593 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms