Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA3O43365 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA3O43365 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA3O43365 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA3O43365 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA3O43365 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA3O43365 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA3O43365 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA3O43365 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA3O43365 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA3O43365 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA3O43365 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA3O43365 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA3O43365 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA3O43365 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA3O43365 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA3O43365 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA3O43365 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA3O43365 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA3O43365 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA3O43365 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA3O43365 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA3O43365 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA3O43365 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA3O43365 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA3O43365 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA3O43365 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA3O43365 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA3O43365 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA3O43365 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA3O43365 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA3O43365 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA3O43365 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA3O43365 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA3O43365 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA3O43365 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA3O43365 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA3O43365 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA3O43365 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA3O43365 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA3O43365 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA3O43365 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA3O43365 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA3O43365 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA3O43365 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA3O43365 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA3O43365 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA3O43365 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA3O43365 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA3O43365 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA3O43365 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA3O43365 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA3O43365 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA3O43365 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA3O43365 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA3O43365 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA3O43365 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA3O43365 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA3O43365 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA3O43365 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA3O43365 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA3O43365 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA3O43365 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA3O43365 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA3O43365 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA3O43365 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA3O43365 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA3O43365 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA3O43365 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA3O43365 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA3O43365 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA3O43365 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA3O43365 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA3O43365 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA3O43365 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA3O43365 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA3O43365 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA3O43365 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA3O43365 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA3O43365 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA3O43365 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA3O43365 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA3O43365 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA3O43365 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA3O43365 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA3O43365 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms