Protein–RNA interactions for Protein: O15228

GNPAT, Dihydroxyacetone phosphate acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPATO15228 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GNPATO15228 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GNPATO15228 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GNPATO15228 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GNPATO15228 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GNPATO15228 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GNPATO15228 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GNPATO15228 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
GNPATO15228 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GNPATO15228 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GNPATO15228 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GNPATO15228 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
GNPATO15228 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GNPATO15228 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GNPATO15228 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GNPATO15228 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GNPATO15228 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GNPATO15228 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GNPATO15228 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GNPATO15228 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GNPATO15228 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GNPATO15228 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GNPATO15228 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GNPATO15228 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GNPATO15228 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GNPATO15228 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GNPATO15228 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GNPATO15228 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GNPATO15228 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GNPATO15228 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GNPATO15228 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GNPATO15228 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
GNPATO15228 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GNPATO15228 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GNPATO15228 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GNPATO15228 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GNPATO15228 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GNPATO15228 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GNPATO15228 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GNPATO15228 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GNPATO15228 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GNPATO15228 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GNPATO15228 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GNPATO15228 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GNPATO15228 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GNPATO15228 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GNPATO15228 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GNPATO15228 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GNPATO15228 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GNPATO15228 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GNPATO15228 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GNPATO15228 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GNPATO15228 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GNPATO15228 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GNPATO15228 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GNPATO15228 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GNPATO15228 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GNPATO15228 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GNPATO15228 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GNPATO15228 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GNPATO15228 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GNPATO15228 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GNPATO15228 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GNPATO15228 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GNPATO15228 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GNPATO15228 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GNPATO15228 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GNPATO15228 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GNPATO15228 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GNPATO15228 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GNPATO15228 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GNPATO15228 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GNPATO15228 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
GNPATO15228 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GNPATO15228 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GNPATO15228 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GNPATO15228 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GNPATO15228 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
GNPATO15228 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GNPATO15228 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GNPATO15228 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GNPATO15228 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GNPATO15228 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GNPATO15228 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GNPATO15228 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GNPATO15228 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GNPATO15228 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GNPATO15228 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GNPATO15228 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GNPATO15228 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GNPATO15228 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GNPATO15228 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GNPATO15228 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GNPATO15228 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GNPATO15228 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GNPATO15228 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GNPATO15228 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GNPATO15228 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GNPATO15228 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GNPATO15228 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms