Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NFKBIEO00221 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NFKBIEO00221 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NFKBIEO00221 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NFKBIEO00221 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NFKBIEO00221 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NFKBIEO00221 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NFKBIEO00221 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NFKBIEO00221 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NFKBIEO00221 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NFKBIEO00221 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NFKBIEO00221 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NFKBIEO00221 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NFKBIEO00221 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NFKBIEO00221 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NFKBIEO00221 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NFKBIEO00221 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NFKBIEO00221 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NFKBIEO00221 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NFKBIEO00221 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NFKBIEO00221 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NFKBIEO00221 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NFKBIEO00221 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NFKBIEO00221 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NFKBIEO00221 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NFKBIEO00221 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NFKBIEO00221 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NFKBIEO00221 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NFKBIEO00221 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NFKBIEO00221 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NFKBIEO00221 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NFKBIEO00221 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NFKBIEO00221 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NFKBIEO00221 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NFKBIEO00221 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NFKBIEO00221 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NFKBIEO00221 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NFKBIEO00221 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NFKBIEO00221 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NFKBIEO00221 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NFKBIEO00221 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NFKBIEO00221 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NFKBIEO00221 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NFKBIEO00221 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NFKBIEO00221 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
NFKBIEO00221 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
NFKBIEO00221 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NFKBIEO00221 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NFKBIEO00221 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NFKBIEO00221 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NFKBIEO00221 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NFKBIEO00221 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NFKBIEO00221 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NFKBIEO00221 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NFKBIEO00221 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NFKBIEO00221 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NFKBIEO00221 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NFKBIEO00221 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NFKBIEO00221 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NFKBIEO00221 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NFKBIEO00221 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NFKBIEO00221 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NFKBIEO00221 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NFKBIEO00221 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NFKBIEO00221 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFKBIEO00221 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFKBIEO00221 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFKBIEO00221 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFKBIEO00221 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFKBIEO00221 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFKBIEO00221 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFKBIEO00221 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFKBIEO00221 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFKBIEO00221 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFKBIEO00221 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFKBIEO00221 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NFKBIEO00221 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFKBIEO00221 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFKBIEO00221 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFKBIEO00221 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFKBIEO00221 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFKBIEO00221 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NFKBIEO00221 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFKBIEO00221 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFKBIEO00221 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFKBIEO00221 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NFKBIEO00221 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NFKBIEO00221 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NFKBIEO00221 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NFKBIEO00221 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NFKBIEO00221 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NFKBIEO00221 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NFKBIEO00221 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NFKBIEO00221 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NFKBIEO00221 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFKBIEO00221 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFKBIEO00221 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFKBIEO00221 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFKBIEO00221 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFKBIEO00221 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms