Protein–RNA interactions for Protein: H7C0C1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C0C1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H7C0C1 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H7C0C1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H7C0C1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
H7C0C1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H7C0C1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
H7C0C1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
H7C0C1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H7C0C1 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
H7C0C1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H7C0C1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H7C0C1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
H7C0C1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H7C0C1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
H7C0C1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H7C0C1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
H7C0C1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H7C0C1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H7C0C1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H7C0C1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H7C0C1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
H7C0C1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H7C0C1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
H7C0C1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
H7C0C1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
H7C0C1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
H7C0C1 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
H7C0C1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H7C0C1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H7C0C1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
H7C0C1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
H7C0C1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H7C0C1 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
H7C0C1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H7C0C1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H7C0C1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H7C0C1 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H7C0C1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H7C0C1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H7C0C1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H7C0C1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
H7C0C1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
H7C0C1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
H7C0C1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H7C0C1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H7C0C1 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
H7C0C1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
H7C0C1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H7C0C1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H7C0C1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
H7C0C1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
H7C0C1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H7C0C1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H7C0C1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H7C0C1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H7C0C1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
H7C0C1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H7C0C1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H7C0C1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H7C0C1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
H7C0C1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
H7C0C1 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H7C0C1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H7C0C1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H7C0C1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
H7C0C1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H7C0C1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H7C0C1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
H7C0C1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
H7C0C1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H7C0C1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
H7C0C1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H7C0C1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
H7C0C1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
H7C0C1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
H7C0C1 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H7C0C1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
H7C0C1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H7C0C1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H7C0C1 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
H7C0C1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
H7C0C1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H7C0C1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H7C0C1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H7C0C1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
H7C0C1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
H7C0C1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
H7C0C1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H7C0C1 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H7C0C1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H7C0C1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H7C0C1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
H7C0C1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H7C0C1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H7C0C1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H7C0C1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
H7C0C1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
H7C0C1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
H7C0C1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
H7C0C1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms