Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms