Protein–RNA interactions for Protein: A6NF36

CCDC182, Coiled-coil domain-containing protein 182, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC182A6NF36 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC182A6NF36 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC182A6NF36 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC182A6NF36 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC182A6NF36 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC182A6NF36 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC182A6NF36 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC182A6NF36 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC182A6NF36 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC182A6NF36 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC182A6NF36 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC182A6NF36 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC182A6NF36 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC182A6NF36 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC182A6NF36 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC182A6NF36 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC182A6NF36 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC182A6NF36 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC182A6NF36 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC182A6NF36 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC182A6NF36 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC182A6NF36 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC182A6NF36 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC182A6NF36 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC182A6NF36 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC182A6NF36 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC182A6NF36 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC182A6NF36 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC182A6NF36 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC182A6NF36 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC182A6NF36 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC182A6NF36 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC182A6NF36 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC182A6NF36 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC182A6NF36 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC182A6NF36 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC182A6NF36 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC182A6NF36 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC182A6NF36 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC182A6NF36 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC182A6NF36 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC182A6NF36 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC182A6NF36 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC182A6NF36 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC182A6NF36 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC182A6NF36 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC182A6NF36 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC182A6NF36 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC182A6NF36 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC182A6NF36 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC182A6NF36 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC182A6NF36 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC182A6NF36 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC182A6NF36 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC182A6NF36 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC182A6NF36 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC182A6NF36 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC182A6NF36 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC182A6NF36 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC182A6NF36 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC182A6NF36 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC182A6NF36 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC182A6NF36 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC182A6NF36 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC182A6NF36 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC182A6NF36 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC182A6NF36 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC182A6NF36 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC182A6NF36 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC182A6NF36 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC182A6NF36 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC182A6NF36 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC182A6NF36 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC182A6NF36 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC182A6NF36 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC182A6NF36 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC182A6NF36 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC182A6NF36 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC182A6NF36 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC182A6NF36 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC182A6NF36 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC182A6NF36 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC182A6NF36 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC182A6NF36 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC182A6NF36 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC182A6NF36 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC182A6NF36 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC182A6NF36 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC182A6NF36 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC182A6NF36 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC182A6NF36 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC182A6NF36 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC182A6NF36 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC182A6NF36 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC182A6NF36 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC182A6NF36 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC182A6NF36 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC182A6NF36 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC182A6NF36 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC182A6NF36 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms