Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PSDA5PKW4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PSDA5PKW4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSDA5PKW4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSDA5PKW4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSDA5PKW4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSDA5PKW4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSDA5PKW4 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSDA5PKW4 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PSDA5PKW4 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSDA5PKW4 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSDA5PKW4 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSDA5PKW4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSDA5PKW4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSDA5PKW4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSDA5PKW4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSDA5PKW4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PSDA5PKW4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PSDA5PKW4 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PSDA5PKW4 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PSDA5PKW4 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PSDA5PKW4 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PSDA5PKW4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PSDA5PKW4 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PSDA5PKW4 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PSDA5PKW4 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PSDA5PKW4 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PSDA5PKW4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PSDA5PKW4 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PSDA5PKW4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
PSDA5PKW4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PSDA5PKW4 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PSDA5PKW4 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PSDA5PKW4 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PSDA5PKW4 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PSDA5PKW4 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PSDA5PKW4 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PSDA5PKW4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PSDA5PKW4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PSDA5PKW4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PSDA5PKW4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PSDA5PKW4 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PSDA5PKW4 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PSDA5PKW4 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PSDA5PKW4 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PSDA5PKW4 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PSDA5PKW4 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PSDA5PKW4 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PSDA5PKW4 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PSDA5PKW4 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PSDA5PKW4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PSDA5PKW4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PSDA5PKW4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PSDA5PKW4 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PSDA5PKW4 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PSDA5PKW4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSDA5PKW4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSDA5PKW4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSDA5PKW4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PSDA5PKW4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSDA5PKW4 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSDA5PKW4 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSDA5PKW4 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PSDA5PKW4 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSDA5PKW4 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSDA5PKW4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSDA5PKW4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSDA5PKW4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSDA5PKW4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSDA5PKW4 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSDA5PKW4 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSDA5PKW4 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSDA5PKW4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSDA5PKW4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSDA5PKW4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSDA5PKW4 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSDA5PKW4 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSDA5PKW4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PSDA5PKW4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PSDA5PKW4 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PSDA5PKW4 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSDA5PKW4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSDA5PKW4 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSDA5PKW4 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSDA5PKW4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSDA5PKW4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSDA5PKW4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSDA5PKW4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSDA5PKW4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSDA5PKW4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSDA5PKW4 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSDA5PKW4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSDA5PKW4 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSDA5PKW4 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSDA5PKW4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSDA5PKW4 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSDA5PKW4 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSDA5PKW4 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSDA5PKW4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSDA5PKW4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms